СРАВНИТЕЛЬНАЯ ОЦЕНКА МЕТОДОВ ТИПИРОВАНИЯ E.COLI - MLST И СЕРОТИПИРОВАНИЯ
DOI:
https://doi.org/10.34689/yczyz011Ключевые слова:
конкордантность , дискриминирующая способность , серотипирование , МЛСТАннотация
Актуальность и цель: Методы субвидового типирования позволяют проводить анализ
генетического родства (клональности) между штаммами микроорганизмов одного вида и
установить возможную эпидемиологическую связь между источниками инфицирования,
факторами передачи возбудителя. Определение и сравнение результатов серологического и
мультилокусного секвенирования типирований на основе полногеномных данных E.coli.
Материал и методы исследования: Определение серологических вариантов и МЛСТ типов
E.coli проводилось на основе полногеномных данных с использованием веб ресурса центра
геномной эпидемиологии (www.genomicepidemiology.org). Разрешающая способность, а также
согласованность результатов проводилась на основании Rand и adj.Wallace индексов.
Результаты и обсуждения: Исследование, проведенное на основе полногеномных данных
E.coli с определение МЛСТ и серотипов продемонстрировало разрешающую способность на
уровне (95-96%). Конкордантность между результатами, полученными двумя методами,
составило 83,9% (95% ДИ 80,2-86,5). Предсказательная способность для МЛСТ на основе О:Н
генотипов 76%, для серотипов используя данные МЛСТ составило 92,2%
Вывод: При схожей разрешающей способности серотипирования и МЛСТ (95-96%),
согласованность результатов в целом составило 84%. При этом, в отношении одних сиквенс
типов наблюдается однозначное соответствие серотипов, в тоже время как для других МЛСТ
типов характерна неоднородная картина серотипов.
Библиографические ссылки
Бабенко Д. Б., Турмухамбетова А. А., Аукенов Н. Е. Сравнительная оценка методов типирования E.coli
- MLST и серотипирования / / Наука и Здравоохранение. 2015. № 6. С. 77-82.
Babenko D. B., Turmukhambetova A. A., Aukenov N. Ye. Comparative evaluation of typing methods for E.coli
- MLST and serotyping. Nauka i Zdravoohranenie [Science & Healthcare]. 2015, 6, pp. 77-82.
Бабенко Д. Б., Турмухамбетова А. А., Аукенов Н. Е. E.coli - MLST типтеу және серотиптеу әдістерін
салыстырмалы бағалау / / Ғылым және Денсаулық сақтау. 2015. № 6. Б. 77-82.
Загрузки
Опубликован
Лицензия
Copyright (c) 2026 Дмитрий Бабенко, Айсулу Турмухамбетова, Нурлан Аукенов (Автор)
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.