МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ КИШЕЧНЫХ БАКТЕРИАЛЬНЫХ СООБЩЕСТВ У КАЗАХСТАНЦЕВ
Введение. Метагеном человека в 100 раз превышает собственный геном и определяет многие физиологические процессы в нашем организме. Метагеном имеет специфические характеристики для каждой популяции, что определяет маркеры заболеваний, течение и пути профилактики и лечения патологий.
Материалы и методы. Исследования проведены согласно процедурам стандартам IHMC (International Human Microbiome Consortium). Настоящее исследование является первым в мире по изучению микробиома популяции Центральной Азии. Сопоставление казахских образцов кишечного микробиома с образцами других популяций, продемонстрировали основные отличия и сходства и установили что микробиом зависит от питания, климато-географических особенностей, образа жизни, социальных факторов, возраста. Мы сравнили микробиоту дистальной части кишечника 149 казахстанцев в возрасте от 25 до 65 лет.
Результаты. Наши исследования показали, что микробиомы различаются в зависимости от климатических и географических особенностей, образа жизни, социальных факторов, возраста. Анализ на уровне mOTU позволил определить микробиомное ядро, которое ввключает следующие роды Faecalibacterium, Bacteroides, Dorea, Collinsella, Oscillibacter, Ruminococcus, Subdoligranulum, Coprococcus, Escherichia, Eberichia, Eberichia Roseburia, Parabacteroides и Prevotella. Микробиомное ядро не изменяется в течение жизни, и формирует энтеротип человека, который определяет риски развития заболеваний, метаболизм лекарственных веществ и особенности питания для поддержания здоровья. Казахстанские образцы в основном относятся к энтеротипу 3. Кроме того, на уровне mOTU мы обнаружили значимые (Spearman FDR <0,05) ассоциации со многими категориями питательных веществ, которые были изучены с помощью опросника FFQ. В связи с изучением функциональности бактериальных генов с использованием базы данных KEGG были определены 44 пути KEGG со значительными различиями, в зависимости от клинических и лабораторных характеристик, а также от анамнеза.
Заключение. Определены основные характеристики кишечного метагенома казахстанцев.
Number of Views: 614
Category of articles:
Original articles
Bibliography link
Kushugulova A.R., Kozhakhmetov S.S., Karabaeva R.Zh., Bakenova R.A., Seidalin N.K., Nurgozhina A.F., Sergazy Sh.D., Nurgaziyev M.A., Chulenbayeva L.E., Khassenbekova Zh.R., Ospanova Zh.O., Tuyakova A.K., Aitenov Ye.O., Gulyaev A.E., Yermekbayeva B.A., Algazina T.O., Batpenova G.R., Nuranova G.A., Baigenzhin A.K., Karibekov T.S., Zhumabayeva M.S., Dossatayeva G.G., Shaimardanova G.M., Kozina L.V., Nurgozhin T.S., Benberin V.V., Zhumadilov Zh.Sh. Metagenomic Analysis of Gut Microbial Communities in Kazakhstan Individuals // Nauka i Zdravookhranenie [Science & Healthcare]. 2020, (Vol.22) 1, pp. 48-57. doi:10.34689/SH.2020.22.1.005Related publications:
VALIDATION OF THE KAZAKH VERSION OF THE DEPRESSION ANXIETY STRESS SCALE (DASS-21) IN MEDICAL FACULTY STAFF SAMPLE: THE PILOT STUDY
PREDICTIVE VALUE OF PSYCHOMETRIC TESTING IN CONTEXT OF CREATING ADAPTIVE ENVIRONMENT FOR HIGHER MEDICAL EDUCATION
ASSESSMENT OF STUDENTS' AWARENESS ABOUT THE HARMS OF MICROPLASTICS ON THE HUMAN BODY
THE IMPACT OF COMPLAINTS ON QUALITY OF LIFE, PSYCHOLOGICAL WELL-BEING AND HEALTH OF MEDICAL WORKERS
DEVELOPMENT AND VALIDATION OF A QUESTIONNAIRE FOR PATIENTS "STUDYING THE OPINION OF PATIENTS' SATISFACTION WITH NURSE INDEPENDENT APPOINTMENT AT THE LEVEL OF PRIMARY HEALTH CARE"