ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВЕННО-УСТОЙЧИВЫХ КЛИНИЧЕСКИХ ИЗОЛЯТОВ M. TUBERCULOSIS В КАЗАХСТАНЕ
Туберкулез, особенно лекарственно-устойчивый туберкулез все еще остается актуальной проблемой медицины в Казахстане. Заболеваемость мультирезистентным туберкулезом в стране за 12 лет увеличилась в 8 раз, с 1,7 до 13,5 на 100000 человек в период между 2003 и 2015 гг. По данным исследований в различных странах, штаммы семейства Beijing M.tuberculosis были ассоциированы с лекарственной устойчивостью, в частности с мультирезистентным туберкулезом. Цель работы: провести генотипирование 192 лекарственно-устойчивых клинических изолятов M.tuberculosis в Казахстане методом сполиготипирования и определить взаимосвязь между лекарственной устойчивостью и генотипом Beijing M.tuberculosis. Результаты сполиготипирования показали, что генотип Beijing является наиболее распространенным среди лекарственно-устойчивых штаммов M. tuberculosis (74,48%) в Казахстане. Определение взаимосвязи генотипа Beijing M. tuberculosis с лекарственной устойчивостью продемонстрировали, что более чем в 50% случаев данный генотип встречался среди полирезистентных (70,9%) и мультирезистентных (87,75%) изолятов.
Улан А. Кожамкулов1, http://orcid.org/0000-0002-9782-7631
Айнур Ж. Ахметова1,2, http:// orcid.org/0000-0002-5557-3338
Венера Л. Бисмилда3, Scopus ID: 8441834800
Ляйля Т. Чингисова3, Scopus ID: 39261046300
Айнур Р. Акильжанова1,2, http://orcid.org/0000-0001-6161-8355
1 Центр наук о жизни, National Laboratory Astana, Назарбаев университет,
г. Нур-Султан, Республика Казахстан;
2 Кафедра общей биологии и геномики, Евразийский национальный университет им. Л.Н. Гумилева, г. Нур-Султан, Республика Казахстан;
3 Национальный научный центр фтизиопульмонологии Республики Казахстан,
г. Алматы, Республика Казахстан.
1. Akhmetova A., Kozhamkulov U., Bismilda V. et al. Mutations in the pncA and rpsA genes among 77 Mycobacterium tuberculosis isolates in Kazakhstan // International Journal Tuberculosis and Lung Diseases. 2015. №19(2). P. 179-184.
2. Coll P., Garcia de Viedma D. Molecular epidemiology of tuberculosis // Enferm Infecc Microbiol Clin. 2018. №36(4). P. 233-240.
3. Garcia de Viedma D., Marin M., Hernangomez S. et al. Tuberculosis recurrences: reinfection plays a role in a population whose clinical/epidemiological characteristics do not favor reinfection // Arch Intern Med. 2002. №162. P. 1873-1879.
4. Ibrayeva A., Kozhamkulov U., Raiymbek D. et al. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis strains circulating in the penitentiary system of Kazakhstan // International Journal Tuberculosis and Lung Diseases. 2014. №18(3). P. 298-301.
5. Ilin A.I., Kulmanov M.E., Korotetskiyet I.S. et al. Complete Genome Sequence of Multidrug-Resistant Clinical Isolate Mycobacterium tuberculosis 187.0, Used To Study the Effect of Drug Susceptibility Reversion by the New Medicinal Drug FS-1 // Genome announcements. 2015. №3(6). P. 1-2.
6. Kairov U., Kozhamkulov U., Molkenov A., Rakhimova S. et al. Draft Genome Sequences of Two Clinical Isolates of Mycobacterium tuberculosis from Sputum of Kazakh Patients // Genome announcements. 2015. №3(3). P. 1-2.
7. Kozhamkulov U., Akhmetova A., Rakhimova S. et al. Molecular characterization of rifampicin- and isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Kazakhstan // Japanese Journal of Infectious Disease. 2011. №64. P. 253-255.
8. Kubica T., Agzamova R., Wright A., Aziz M.A., Rakishev G., Bismilda V., Richter E., Rüsch-Gerdes S., Niemann S. The Beijing genotype is a major cause of drug-resistant tuberculosis in Kazakhstan // Int J Tuberc Lung Dis. 2005. №9(6). P. 646–653.
9. Navarro Y., Herranz M., Perez-Lago L. et al. Systematic survey of clonal complexity in tuberculosis at a populational level and detailed characterization of the isolates involved // J Clin Microbiol. 2011. №49. P. 4131-4137.
10. Niemann S., Diel R., Khechinashvili G., Gegia M., Mdivani N., Tang Y. Mycobacterium Tuberculosis Beijing Lineage Favors the Spread of Multidrug-Resistant Tuberculosis in the Republic of Georgia // J Clin Microbiol. 2010. №48(10). P. 3544-50.
11. Reichman L.B. et.al. The global epidemic of multi-drug-resistant tuberculosis. - New York: McGraw-Hill. 2001. P.320.
12. San et.al. Insight into multidrug-resistant Beijing genotype Mycobacterium tuberculosis isolates in Myanmar // International Journal of Infectious Diseases. 2018. №76. P. 109-119.
13. Skiba Y., Mokrousov I., Ismagulova G. et al. Molecular snapshot of Mycobacterium tuberculosis population in Kazakhstan: A country-wide study // Tuberculosis. 2015. №95(5). P. 538-546.
14. Statistic TB Review (Editor Zh.K. Ismailov). Ministry of Health Republic of Kazakhstan. – Almaty: National TB Center. 2017. P. 75.
15. Van Soolingen, D., Qian, L., de Haas, P. E. et al. Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of East Asia // J. Clin. Microbiol. 1995. №l33. P. 3234-3238.
16. Van Soolingen D., Kremer K., Vynycky E. New perspectives in the molecular epidemiology of tuberculosis // In book: Mycobacteria and TB. Berlin. 2003. №2. P. 17-45.
17. Verver S., Warren R.M., Munch Z. et al. Proportion of tuberculosis transmission that takes place in households in a high-incidence area // Lancet. 2004. №363. P. 212-214.
18. World Health Organization. Laboratory services in tuberculosis control. Part III. Geneva. WHO. 1998. P. 65.
19. World Health Organization. Guidelines for surveillance of drug resistance in tuberculosis. Ed. 2nd. Geneva. World Health Organization. 2003. P. 73.
20. World Health Organization: Global tuberculosis report 2015 (Ed. 20th). Geneva: World Health Organisation. 2015. P. 204.
21. Yin Q.Q. et al. Evolutionary history and ongoing transmission of phylogenetic lineages of M. tuberculosis Beijing genotype in China // Scientific reports. 2016. №6:34353. Р. 1-11.
Количество просмотров: 717
Категория статей:
Оригинальные исследования
Библиографическая ссылка
Кожамкулов У.А., Ахметова А.Ж., Бисмилда В.Л., Чингисова Л.Т., Акильжанова А.Р. Генотипирование лекарственно-устойчивых клинических изолятов M. Tuberculosis в Казахстане // Наука и Здравоохранение. 2020. 4 (Т.22). С. 71-79. doi 10.34689/SH.2020.22.4.007Похожие публикации:
МЕХАНИКАЛЫҚ САРҒАЮ ОПЕРАЦИЯСЫ КЕЗІНДЕ КОАГУЛОПАТИЯЛЫҚ ҚАН КЕТУДІҢ АЛДЫН АЛУ ӘДІСІ
ОПТИМИЗАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ АУТОДЕРМОПЛАСТИКИ ПРИ ЛЕЧЕНИИ ГРАНУЛИРУЮЩИХ ГНОЙНЫХ РАН
BASICS OF REHABILITATION OF CHILDREN AFTER OPERATIONS ON THE COLON AND ANORECTAL AREA
HEALTH INDICATORS OF FIRST-YEAR-OF-LIFE CHILDREN IN THE REPUBLIC OF KAZAKHSTAN FOR 2013-2022
ОЦЕНКА УДОВЛЕТВОРЕННОСТИ ТРУДОВОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬЮ ВРАЧЕЙ АНЕСТЕЗИОЛОГОВ-РЕАНИМАТОЛОГОВ ГОРОДА АСТАНА