ҚАЗАҚСТАНДАҒЫ ЖЕКЕ АДАМДАРДЫҢ ІШЕК МИКРОБТЫҚ ҚАУЫМДАСТЫҒЫН МЕТАГЕНОМИКАЛЫҚ ТАЛДАУ
Кіріспе Адамның метагеномы өзінің геномынан 100 есе үлкен және денеміздегі көптеген физиологиялық процестерді анықтайды. Метагеноманың әр популяцияға тән сипаттамалары бар, олар аурулардың белгілерін, патологияны алдын-алу және емдеу жолдарын анықтайды.
Материалдар мен әдістер. Зерттеулер IHMC (Халықаралық адам микробиомасы консорциумы) стандарттарына сәйкес жүргізілді.
Нәтижелер. Бұл зерттеулер Орта Азияда популяция микробиомын зерттеу бойынша дүниежүзіндегі алғашқы зерттеу. Ішек микробиомының қазақстандық үлгілерін басқа популяциялармен салыстыру – негізгі айырмашылықтар мен ұқсастықтарды көрсетті және микробиомның тамақтануға, климаттық және географиялық ерекшеліктеріне, өмір салтына, әлеуметтік факторларға, жасына байланысты екендігі анықталды.
Біз 25 пен 65 жас аралығындағы 149 қазақстандықтың дистальды ішектің микробиоталарын салыстырдық. Біздің зерттеулеріміз микробиомалардың климаттық және географиялық ерекшеліктерге, өмір салтына, әлеуметтік факторларға, жасына байланысты ерекшеленетінін көрсетті. мOTU деңгейіндегі талдау микробиомның ядросын анықтауға мүмкіндік берді, оның құрамына келесі туыстар кіреді: Faecalibacterium, Bacteroides, Dorea, Collinsella, Oscillibacter, Ruminococcus, Subdoligranulum, Coprococcus, Escherichia, Eberichia, Eberichia Roseburia, Parabacteroides және Prevotella Микробиомның ядросы өмір бойы өзгермейді және денсаулықты сақтау үшін аурулардың даму қаупін анықтайтын, дәрілердің метаболизмі мен тамақтану ерекшеліктерін анықтайтын адамның энтеротипін құрайды. Қазақстандық үлгілер негізінен энтеротип 3-ке енеді. Сонымен қатар, MOTU деңгейінде FFQ сауалнамасы арқылы зерттелген көптеген қоректік заттардың санаттары бар маңызды қауымдастықтар табылды (Spearman FDR <0.05). KEGG деректер базасын қолдана отырып, бактериалды гендердің функционалдығын зерттеуге сай клиникалық және зертханалық сипаттамаларына, сондай-ақ медициналық тарихына байланысты 44 KEGG жолы айтарлықтай айырмашылықтары бар екендігі анықталды.
Қорытынды. Қазақстандықтардың ішек метагеномының негізгі сипаттамалары анықталды.
Алмагуль Р. Кушугулова1,2*, Самат С. Кожахметов,2, Раушан Ж. Карабаева3, Роза А. Бакенова3, Назар К. Сейдалин3, Аяулым Ф. Нургожина1,2, Шынгыс Д. Сергазы1,2, Мадияр А. Нургазиев1,2, Лаура Е. Чуленбаева1,2, Жанагуль Р. Хасенбекова2, Жанна О. Оспанова2, Алтынай К. Туякова1,2, Ермек О. Айтенов1,2, Александр Е. Гуляев1,2, Бакытгуль А. Ермекбаева4, Тогжан О. Алгазина5, Гульнар Р. Батпенова5, Гульназ А. Нуранова5, Абай К. Байгенжин6, Темирлан С. Карибеков6, Майя С. Жумабаева6, Гульмира Г. Досатаева6, Галия М. Шаймарданова6, Лариса В. Козина6, Талгат С. Нургожин7, Валерий В. Бенберин3, Жаксыбай Ш. Жумадилов1,4
Institutes:
1 National Laboratory Astana Назарбаев Университеті,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
2 Адам микробиомасын зерттеушілердің қазақстандық қоғамы,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
3 Қазақстан Республикасы Президенті Іс басқармасы Медициналық орталығының Ауруханасы,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
4 University Medical Center, Назарбаев Университеті,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
5 Нұр-Сұлтан (Астана) медицина университеті,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
6Ұлттық ғылыми медициналық орталық,
Нұр-Сұлтан қ., Қазақстан Республикасы;
7 С.Ж. Асфендияров атындағы Қазақ ұлттық медицина университеті,
Almaty қ., Қазақстан Республикасы.
1. Alcock J., Maley C.C., Aktipis C.A. Is eating behavior manipulated by the gastrointestinal microbiota? Evolutionary pressures and potential mechanisms // BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 2014. № 10 (36). C. 940–949.
2. Algazina T. [и др.]. Features of microbiota in psoriatic disease: from skin and gut perspectives (review) // Georgian medical news. 2019. № 287.
3. Amedei A., Morbidelli L. Circulating metabolites originating from gut microbiota control endothelial cell function // Molecules. 2019. Т. 24. № 21.
4. Bar-On Y.M., Milo R. The global mass and average rate of rubisco // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2019. № 10 (116). C. 4738.
5. Chatelier E. Le [и др.]. Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers // Nature. 2013. № 7464 (500). C. 541–546.
6. Consortium H.M.J.R.S. [и др.]. A catalog of reference genomes from the human microbiome // Science (New York, N.Y.). 2010. № 5981 (328). C. 994–999.
7. Consortium H.M.P. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome // Nature. 2012. № 7402 (486). C. 207–214.
8. Costea P.I. [и др.]. Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition // Nature microbiology. 2018. № 1 (3). C. 8–16.
9. Eckburg P.B. [и др.]. Diversity of the human intestinal microbial flora // Science (New York, N.Y.). 2005. № 5728 (308). C. 1635–1638.
10. Eren A.M. [и др.]. A single genus in the gut microbiome reflects host preference and specificity // The ISME journal. 2015. № 1 (9). C. 90–100.
11. Frati F. [и др.]. The Role of the Microbiome in Asthma: The Gut−Lung Axis // International journal of molecular sciences. 2018. № 1 (20). C. 123.
12. Group N.I.H.H.M.P.W. [и др.]. The NIH Human Microbiome Project // Genome research. 2009. № 12 (19). C. 2317–2323.
13. Karlsson F.H. [и др.]. Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control // Nature. 2013. № 7452 (498). C. 99–103.
14. Kushugulova A. [и др.]. Metagenomic analysis of gut microbial communities from a Central Asian population // BMJ Open. 2018. № 7 (8). C. 1–12.
15. Lee Y.S. [и др.]. Microbiota-Derived Lactate Accelerates Intestinal Stem-Cell-Mediated Epithelial Development // Cell Host and Microbe. 2018. № 6 (24). C. 833-846.e6.
16. Mulligan A.A. [и др.]. A new tool for converting food frequency questionnaire data into nutrient and food group values: FETA research methods and availability // BMJ Open. 2014. № 3 (4).
17. Qin J. [и др.]. A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes // Nature. 2012. № 7418 (490). C. 55–60.
18. Sender R., Fuchs S., Milo R. Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body // PLoS biology. 2016. № 8 (14). C. e1002533–e1002533.
19. Sh. Askarova [и др.]. Intestinal Microbiome and Alzheimer’s Disease // Experimental Biology. 2019. № 4 (77). C. 74–85.
20. Wirbel J. [и др.]. Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer // Nature medicine. 2019. № 4 (25). C. 679–689.
21. Zeller G. [и др.]. Potential of fecal microbiota for early-stage detection of colorectal cancer // Molecular systems biology. 2014. № 11 (10). C. 766.
22. Zhang J. [и др.]. Mongolians core gut microbiota and its correlation with seasonal dietary changes // Scientific reports. 2014. (4). C. 5001.
23. astana/weather/climate/ [Электронный ресурс]. URL: www.meteo-tv.ru/kazahstan/astana/astana/weather/climate/.
Көрген адамдардың саны: 221
Мақалалар санаты:
Біртума зерттеулер
Библиографиялық сілтемелер
Кушугулова А.Р., Кожахметов С.С., Карабаева Р.Ж., Бакенова Р.А., Сейдалин Н.К., Нургожина А.Ф., Сергазы Ш.Д., Нургазиев М.А., Чуленбаева Л.Е., Хасенбекова Ж.Р., Оспанова Ж.О., Туякова А.К., Айтенов Е.О., Гуляев А.Е., Ермекбаева Б.А., Алгазина Т.О., Батпенова Г.Р., Нуранова Г.А., Байгенжин А.К., Карибеков Т.С., Жумабаева М.С., Досатаева Г.Г., Шаймарданова Г.М., Козина Л.В., Нургожин Т.С., Бенберин В.В., Жумадилов Ж.Ш. Қазақстандағы жеке адамдардың ішек микробтық қауымдастығын метагеномикалық талдау // Ғылым және Денсаулық сақтау. 2020. 1 (Т.22). Б. 48-57. doi:10.34689/SH.2020.22.1.005Ұқсас жариялымдар:
РАДИОЛОГИЯДА ЖАЛПЫ ТРУНКУС АРТЕРИОЗЫН ЗЕРТТЕУДІҢ ДИАГНОСТИКАЛЫҚ ӘДІСТЕРІ
МЕХАНИКАЛЫҚ САРҒАЮ ОПЕРАЦИЯСЫ КЕЗІНДЕ КОАГУЛОПАТИЯЛЫҚ ҚАН КЕТУДІҢ АЛДЫН АЛУ ӘДІСІ
ТҮЙІРШІКТЕЛГЕН ІРІҢДІ ЖАРАЛАРДЫ АУТОТЕРІЖАМАУМЕН ЕМДЕУДІҢ ОҢТАЙЛАНДЫРУ НӘТИЖЕЛЕРІ
ЖУАН ІШЕК ПЕН АНОРЕКТАЛДЫ АЙМАҚҚА ОПЕРАЦИЯ ЖАСАҒАН БАЛАЛАРДЫ РЕАБИЛИТАЦИЯЛАУ НЕГІЗДЕРІ
ҚАЗАҚСТАН РЕСПУБЛИКАСЫНДАҒЫ 2013-2022 ЖЫЛДАРҒА АРНАЛҒАН ӨМІРІНІҢ БІРІНШІ ЖЫЛЫНДАҒЫ БАЛАЛАРДЫҢ ДЕНСАУЛЫҚ КӨРСЕТКІШТЕРІ